MRI可利用被檢組織的物理和生物化學(xué)特性(如水、鐵、脂肪、血管外血液及其分解后的產(chǎn)物等) 來(lái)作組織特性的評(píng)價(jià)，并區(qū)別不同組織。通過(guò)流動(dòng)效應(yīng)來(lái)評(píng)價(jià)血流和腦脊液的流動(dòng)。自旋回波序列掃描時(shí)，骨皮質(zhì)及鈣不發(fā)射信號(hào)。因此，為骨骼所包圍的組織，如后顱窩和椎管內(nèi)的組織顯示清楚，不受因骨產(chǎn)生的偽影所影響。MRI 掃描時(shí)，無(wú)需移動(dòng)病人即可作多方向的掃描，因此在制定臨床醫(yī)學(xué)放射治療和手術(shù)方案時(shí)很有幫助。MRI 增強(qiáng)掃描時(shí)所用的順磁性造影劑無(wú)毒性反應(yīng)，使我們能研究血腦屏障的完整性。

MRI圖像信號(hào)的采集不是利用電離輻射，也無(wú)需含碘的造影劑；在檢查前不用對(duì)病人進(jìn)行特殊的準(zhǔn)備；加之它是一種無(wú)創(chuàng)傷性的檢查，所以易為病人所接受。

盡管MRI 具備上述技術(shù)上的優(yōu)勢(shì)，但也有一定的不足之處，如：

扭描時(shí)信號(hào)采集較慢，需時(shí)較長(zhǎng)。重危病人，不能很好合作和配合的病人，仍不能接受此項(xiàng)檢查，或因監(jiān)護(hù)系統(tǒng)及生命維持系統(tǒng)不能進(jìn)入醫(yī)學(xué)影像磁體房，或因掃描時(shí)間太長(zhǎng)而不能耐受。由于磁體掃描膛較小，少數(shù)病人會(huì)有幽閉感，不能很好配合只得中止檢查。另外對(duì)過(guò)于肥胖的病人亦不易進(jìn)入掃描膛，或即使進(jìn)入，也可能因肢體碰觸線圈而造成圖像不良。帶有心臟起搏器或體內(nèi)帶有磁鐵性醫(yī)療裝置的病人均受到限制，不能接受檢查。

自旋回波成像時(shí)，鈣無(wú)信號(hào)，在診斷以病理鈣化為特征的病變時(shí)，會(huì)受到影響。MRI 是一種高科技成像儀器，需要一定的技術(shù)力量和器材來(lái)維持其運(yùn)轉(zhuǎn)，因此費(fèi)用較高。